Дедик.ру | выделенный сервер.

Можно, только осторожно.
Делается как обычно - с консоли.

Не получается из этого Plesk запустить WEB SSH-клиента :(
Вместо консоли чистое окно без курсора.
Пробовал из разных браузеров.

Собственно, этот SSH-клиент и есть все средства для "брожения" по серверу в Plesk?

браузер основаный ssh клиент в плеске, сделан на java, так что скорей всего у вашего browser выключена поддержка или не стоит WM.

А касательно самого вопроса.
Тут сама философия намного глубже. Плеск ограждает Вас, как пользователя от того что можно наделать конфигурируя вышеперечисленные файлы и как мне кажется это правильно, с другой стороны, в том случае если вы продвинутый пользователей то Plesk ограждает, но не запрещает...

у вас есть несколько вариантов управление конфигом вебсервера.
1-й: на уровне домена: в каждом домене есть папка conf/ там можно создать файлы vhost.conf и vhost_ssl.conf и вносить нужные вам настройки, которые подключатся к основному конфигу.

2-й: ну и наиболее опасный и рекомендованый только продвинутым пользователям, изминение основного конфиг файла веб сервера, вам не запрешают его менять, а не рекомендуют.

конфиги найдете на их обычных местах в зависимости от OS, к примеру rh:
/etc/my.cnf
/etc/httpd/conf/httpd.conf

www.keyweb.ru - хостинг виртуальных и выделенных серверов